MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Clostridium difficile BI1

Total Repeats: 23912

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017179	T	7	7	1368	1374	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_017179	ATT	2	6	1383	1388	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_017179	TTA	2	6	1473	1478	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_017179	CAA	2	6	1486	1491	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_017179	CTA	3	9	1495	1503	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
6	NC_017179	TAC	2	6	1505	1510	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
7	NC_017179	TA	4	8	1530	1537	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_017179	AGG	2	6	1547	1552	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
9	NC_017179	AGG	2	6	2792	2797	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
10	NC_017179	A	7	7	10639	10645	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_017179	A	6	6	10692	10697	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_017179	AAAC	2	8	10755	10762	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
13	NC_017179	GGC	2	6	10849	10854	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
14	NC_017179	GCG	2	6	10897	10902	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_017179	AC	3	6	10937	10942	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
16	NC_017179	ATA	2	6	10975	10980	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_017179	GGTAA	2	10	11052	11061	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
18	NC_017179	CGA	2	6	11075	11080	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_017179	GCA	2	6	11149	11154	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_017179	GCA	2	6	11189	11194	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
21	NC_017179	CGC	2	6	11196	11201	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
22	NC_017179	GTGA	2	8	11202	11209	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
23	NC_017179	GAG	2	6	11264	11269	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
24	NC_017179	CAG	2	6	11292	11297	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
25	NC_017179	GTA	2	6	11398	11403	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
26	NC_017179	AGGAG	2	10	11432	11441	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
27	NC_017179	AGG	2	6	11481	11486	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
28	NC_017179	GGC	2	6	11502	11507	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
29	NC_017179	GAA	2	6	11744	11749	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
30	NC_017179	GGT	2	6	11820	11825	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
31	NC_017179	GTC	2	6	11834	11839	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
32	NC_017179	TCGTG	2	10	11843	11852	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
33	NC_017179	CAT	2	6	11902	11907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
34	NC_017179	AG	3	6	11923	11928	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
35	NC_017179	GGA	2	6	11946	11951	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
36	NC_017179	ATC	2	6	11970	11975	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_017179	AC	3	6	11997	12002	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
38	NC_017179	GTA	2	6	12015	12020	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
39	NC_017179	TGC	2	6	12136	12141	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
40	NC_017179	AC	3	6	12166	12171	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
41	NC_017179	CAC	2	6	12181	12186	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
42	NC_017179	GAA	2	6	12227	12232	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
43	NC_017179	GTC	2	6	12233	12238	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
44	NC_017179	CCT	2	6	12307	12312	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
45	NC_017179	GTTT	2	8	12412	12419	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
46	NC_017179	AT	4	8	12495	12502	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_017179	AT	3	6	12528	12533	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_017179	TTA	2	6	12605	12610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_017179	GAAG	2	8	12809	12816	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
50	NC_017179	AGAA	2	8	12817	12824	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
51	NC_017179	GCG	2	6	12842	12847	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
52	NC_017179	CAC	2	6	12948	12953	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
53	NC_017179	AGG	2	6	13039	13044	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
54	NC_017179	ACC	2	6	13046	13051	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
55	NC_017179	TAC	2	6	13065	13070	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
56	NC_017179	GGGAG	2	10	13121	13130	20 %	0 %	80 %	0 %	Non-Coding
57	NC_017179	TG	3	6	13181	13186	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
58	NC_017179	GA	3	6	13481	13486	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
59	NC_017179	TAAGT	2	10	13646	13655	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
60	NC_017179	AGC	2	6	13702	13707	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
61	NC_017179	TAC	2	6	13780	13785	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
62	NC_017179	ATG	2	6	13805	13810	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
63	NC_017179	ACA	2	6	14005	14010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
64	NC_017179	TAC	2	6	14025	14030	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
65	NC_017179	GA	3	6	14043	14048	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
66	NC_017179	TAAGC	2	10	14067	14076	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
67	NC_017179	TG	3	6	14090	14095	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
68	NC_017179	TAG	2	6	14167	14172	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
69	NC_017179	GGTG	2	8	14247	14254	0 %	25 %	75 %	0 %	Non-Coding
70	NC_017179	GA	3	6	14277	14282	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
71	NC_017179	TGT	2	6	14285	14290	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
72	NC_017179	CCA	2	6	14336	14341	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
73	NC_017179	CGG	2	6	14501	14506	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_017179	CAA	2	6	14595	14600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_017179	TAC	2	6	14701	14706	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
76	NC_017179	ACC	2	6	14772	14777	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
77	NC_017179	GTA	2	6	14781	14786	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
78	NC_017179	TC	3	6	14892	14897	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
79	NC_017179	CGTA	2	8	14913	14920	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
80	NC_017179	AG	3	6	14936	14941	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
81	NC_017179	GGT	2	6	14996	15001	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
82	NC_017179	TCA	2	6	15111	15116	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
83	NC_017179	GTA	2	6	15129	15134	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
84	NC_017179	CGT	2	6	15191	15196	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
85	NC_017179	AAGAT	2	10	15375	15384	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
86	NC_017179	GCA	2	6	15446	15451	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
87	NC_017179	ATT	2	6	15497	15502	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
88	NC_017179	TCAT	2	8	15508	15515	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
89	NC_017179	AT	3	6	15520	15525	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_017179	A	6	6	15601	15606	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_017179	A	7	7	15613	15619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_017179	TTA	2	6	15645	15650	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_017179	A	7	7	15666	15672	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
94	NC_017179	AAT	2	6	15692	15697	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_017179	AG	3	6	15712	15717	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
96	NC_017179	CT	3	6	15754	15759	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
97	NC_017179	TGG	2	6	15775	15780	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
98	NC_017179	CAC	2	6	15903	15908	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
99	NC_017179	ATT	2	6	15911	15916	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_017179	CAC	2	6	15991	15996	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
101	NC_017179	AAT	2	6	15997	16002	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_017179	AAAC	2	8	16048	16055	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
103	NC_017179	GGC	2	6	16142	16147	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_017179	GCG	2	6	16190	16195	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
105	NC_017179	AC	3	6	16230	16235	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_017179	ATA	2	6	16268	16273	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_017179	GGTAA	2	10	16345	16354	40 %	20 %	40 %	0 %	Non-Coding
108	NC_017179	CGA	2	6	16368	16373	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
109	NC_017179	GCA	2	6	16442	16447	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
110	NC_017179	GCA	2	6	16482	16487	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
111	NC_017179	CGC	2	6	16489	16494	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
112	NC_017179	GTGA	2	8	16495	16502	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
113	NC_017179	GAG	2	6	16557	16562	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
114	NC_017179	CAG	2	6	16585	16590	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
115	NC_017179	GTA	2	6	16691	16696	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
116	NC_017179	AGGAG	2	10	16725	16734	40 %	0 %	60 %	0 %	Non-Coding
117	NC_017179	AGG	2	6	16774	16779	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
118	NC_017179	GGC	2	6	16795	16800	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
119	NC_017179	GAA	2	6	17037	17042	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
120	NC_017179	GGT	2	6	17113	17118	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
121	NC_017179	GTC	2	6	17127	17132	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
122	NC_017179	TCGTG	2	10	17136	17145	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
123	NC_017179	CAT	2	6	17195	17200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
124	NC_017179	AG	3	6	17216	17221	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
125	NC_017179	GGA	2	6	17239	17244	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
126	NC_017179	ATC	2	6	17263	17268	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
127	NC_017179	AC	3	6	17290	17295	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
128	NC_017179	GTA	2	6	17308	17313	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
129	NC_017179	TGC	2	6	17429	17434	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
130	NC_017179	AC	3	6	17459	17464	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
131	NC_017179	CAC	2	6	17474	17479	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
132	NC_017179	GAA	2	6	17520	17525	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
133	NC_017179	GTC	2	6	17526	17531	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
134	NC_017179	CCT	2	6	17600	17605	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
135	NC_017179	TA	3	6	17656	17661	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
136	NC_017179	CTTGC	2	10	17689	17698	0 %	40 %	20 %	40 %	Non-Coding
137	NC_017179	CTC	2	6	17723	17728	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
138	NC_017179	CCA	2	6	17733	17738	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
139	NC_017179	TAG	2	6	17773	17778	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
140	NC_017179	AT	4	8	17886	17893	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_017179	AT	3	6	17919	17924	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_017179	TTA	2	6	17996	18001	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
143	NC_017179	GAAG	2	8	18200	18207	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
144	NC_017179	AGAA	2	8	18208	18215	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
145	NC_017179	GCG	2	6	18233	18238	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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152	NC_017179	GA	3	6	18872	18877	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
153	NC_017179	TAAGT	2	10	19037	19046	40 %	40 %	20 %	0 %	Non-Coding
154	NC_017179	AGC	2	6	19093	19098	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
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156	NC_017179	ATG	2	6	19196	19201	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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159	NC_017179	GA	3	6	19434	19439	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
160	NC_017179	TAAGC	2	10	19458	19467	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
161	NC_017179	TG	3	6	19481	19486	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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197	NC_017179	T	7	7	22998	23004	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
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287	NC_017179	GTC	2	6	31846	31851	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
288	NC_017179	CCT	2	6	31920	31925	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
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